A jovem Jeniffer uma linda e brilhante cientista que sonha em seguir os passos do seu avó, um conceituado Oceanógrafo que por anos contribuiu com a sociedade científica e desvendou mistérios no fundo dos oceanos da Terra. Agora a nossa pequena heroína quer fazer o mesmo, mas para conseguir o reconhecimento dos seus colegas de profissão ela foi desafiada a provar suas capacidades.
Decidida a mostrar a aqueles orgulhosos uma lição, resolveu construir uma replica perfeita de uma área do oceano, em outras palavras um aquário gigante, o maior que o mundo já viu! Mas para isso ela vai precisar de muito dinheiro, coisa que ela não tem. Então como fazê-lo? É aí que ela tem a brilhante idéia de Jeniffer: entrar de cabeça no fundo do mar à procura de tesouros perdidos!
Esse é o mote mais que engraçado do game Fishdom 2, continuação de um popular game de estratégia Fishdom. O game é uma mistura de puzzle (quebra-cabeça) com point-and-click (aponte e clique). Entre as fases você terá a oportunidade de vasculhar o fundo do oceano a procura de itens e tesouros de todos os tipos, mas não será nada fácil, pois para descobrir onde estão enterrados, será preciso desvendar alguns quebra-cabeças.
No inicio o desafio é relativamente fácil, mas com o tempo ele se torna cada vez mais difícil com enigmas enormes, que preenchem a tela inteira. Como em todo game do gênero é preciso juntar três pedras de cores iguais ou do mesmo tipo para destruí-las e assim esvaziar a tela. Ao limpar toda ela você recebe, alem de dicas sobre o paradeiro do tesouro, uma série de objetos que serão essenciais ao longo da sua jornada marítima.